最近，由4001老百汇网站与沙特阿卜杜拉国王科技城（King Abdulaziz City for Science and Technology, KACST）配合启动的合作项目“枣椰 (Phoenix dactylifera L.)基因组妄想”获得系列希望，本月初其标记性研究——枣椰全基因组草图在《Nature Communications》杂志揭晓 。
“中沙枣椰基因组妄想”始于2008年8月，旨在与沙特王国科学界建设亲近合作，共建系统的基因组学研究平台，并团结开展人类遗传学和疾病基因组学、棕榈科植物（枣椰、椰子、油棕等）、主要农作物（如水稻、木樨等）、沙漠抗旱植物、油井情形微生物等基因组测序与较量基因组学等科学研究项目 。枣椰是中东和北非地区普遍莳植的主要农作物，具有主要的经济价值 。而其所在的棕榈科物种繁多，漫衍普遍，系统分类职位特殊 。为了展现枣椰的产量、生殖和抗逆中分子遗传机制，基因组所于军研究员和胡松年研究员向导的研究团队首先开展了枣椰基因组测序项目 。
该研究团队获得了椰枣主要莳植品系(Khalas)的高质量基因组组装效果和另外三个枣椰品系的高笼罩度基因组草图 。Khalas基因组组装巨细为605.4 Mb，笼罩了全基因组序列（~671 Mb）的90%以上和枣椰基因的96%（41,660）以上 。枣椰基因组序列剖析效果批注其基因组履历了一次显着的基因组加倍（genome-wide duplication，GWD）和一次潜在的基因组加倍或大规模基因组片断加倍 。遗传变异剖析显示胁迫对抗基因和糖代谢相关基因趋向于集中在染色体低SNP频率区 。
使用大宗的转录组数据，科研职员剖析了枣椰果实的发育和成熟时期奇异的糖代谢转变 。这种大规�；蜃楹妥甲槭菸徊降囊婊蜃檠芯亢推渌亻悼浦参锏难芯康于嘶� 。别的，该研究还获得了第一个棕榈科植物—枣椰的叶绿体基因组序列，有助于相识棕榈科叶绿体基因组的结构特点，以及进化历程中基因组变异情形 。
本合作项目的中方首席科学家、基因组所于军教授先容，该研究的基因组拼接质量较高，剖析了椰枣从花期到发育成熟历程的基因表达谱，展现了椰枣多糖因素代谢途径的几个要害转折点，为枣椰基因组学和种种组学研究涤讪了坚实的分子基础，具有很高的适用价值 。别的，文章还首次报道了植物基因组重复序列家族在差别谱系中和谱系间的转变特征 。
文章链接：http://www.nature.com/ncomms/2013/130806/ncomms3274/full/ncomms3274.html
椰枣果实差别发育时期糖代谢相关基因的表达谱
