北京基因组所（国家生物信息中心）宣布人类癌症可变剪接知识库ASCancer Atlas
克日 ，4001老百汇网站（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心合作开发的人类癌症可变剪接知识库（ASCancer Atlas）正式上线。该研究效果以“ASCancer Atlas: a comprehensive knowledgebase of alternative splicing in human cancers”为题在国际学术期刊Nucleic Acid Research 在线揭晓。
已往十年大宗的研究批注 ，可变剪接异常与肿瘤的爆发、生长以及耐药亲近相关。剪接失调陪同着许多要害生物学历程改变 ，涵盖险些所有的癌症特征。随着对致癌性异常剪接研究的一直累积 ，迫切需要周全整合实验验证的癌症特异性剪接事务及其功效轴信息 ，以便从全局角度更好地相识可变剪接调控机制。为此 ，国家生物信息中心研究团队开发了ASCancer Atlas知识库 ，为研究职员提供了一个较为完善的人类癌症可变剪接信息资源。
现在 ，ASCancer Atlas主要网络两类癌症相关剪接事务：实验验证的剪接事务和盘算要领推断的剪接事务。首先 ，基于610篇已果真揭晓的文献 ，人工审编了2,006条实验验证的癌症特异性剪接事务 ，共涉及29小我私家类癌症原发性位点及60种癌症亚型。每个异常剪接事务都纪录了其相对完整的功效轴 ，主要包括上游调控机制、剪接事务注释、下游致癌作用以及可能的治疗战略。别的 ，它还整合了约两百万个盘算推断的剪接事务 ，涵盖33种TCGA癌症类型以及31种GTEx正常组织类型。最后 ，数据库还提供了一系列可视化和在线剖析工具用于进一步探索这些剪接事务的潜在调控机制、临床相关性以及衍生的药物反应。
ASCancer Atlas开发了一系列用户友好的网页 ，以支持研究职员交互式浏览、检索、可视化、剖析和下载人类癌症可变剪接资源。ASCancer Atlas是第一个较为周全的人类癌症可变剪接知识库 ，为全方位研究癌症中的剪接失调提供数据和信息支持。随着越来越多的剪接变异体被识别为癌症治疗的靶标 ，ASCancer Atlas将为人类癌症研究提供更多增值服务。
北京基因组研究所（国家生物信息中心）博士研究生吴松及黄悦为本文配合第一作者 ，鲍一明研究员、刘肇祺研究员与李茹姣高级工程师为配合通讯作者。本事情获得国家重点研发专项、中科院战略性先导科技专项及国家自然科学基金等项目资助。
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